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基于CRISPR/CAS9的基因敲除敲入服务

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苏州东岭生物技术有限公司(东岭生物,DL Biotech)创建于2016年,拥有在干细胞和肿瘤免疫研究领域深耕数十年的技术团队,企业愿景是成为国内领先的免疫治疗药物研发技术服务供应商,同时研发生产关键试剂替代进口。经过4年多的努力,公司已建成干细胞/免疫细胞系统鉴定检测平台和基因编辑平台,可为免疫治疗药物研发机构提供定制服务方案及工具产品。




基于CRISPR/CAS9的基因敲除敲入服务
(一)背景介绍


CRISPR/Cas9是一种在特定目标位置切割DNA的工具,Cas9蛋白可在sgRNA的引导下对特定基因进行剪切,从而达到基因敲除、敲入以及修饰、调控等目的。

敲除:与常规的shRNA敲低不同,CRISPR/CAS9和sgRNA可特异性的在基因组水平造成碱基的缺失或插入(INDEL),造成原有基因表达框的破坏,造成靶基因蛋白水平的完全敲除(图1左)。

敲入:与常规病毒介导的过表达不同,CRISPR/CAS9和sgRNA在特定基因组位点切割后,可在带有同源臂的修复模板引导下,将待敲入的基因插入到目的位点,不同于病毒介导的随机整合(图1右)。

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图1:CRISPR/CAS9工作示意图

图片出引自:Front. Plant Sci., 24 May 2016


(二)东岭CRISPR/CAS9相关服务项目


东岭提供CRISPR/CAS9敲除和敲入环节所需的载体和病毒,亦可为客户提供一站式服务,周期及项目见下表:


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注:定制服务包括敲入服务、稳定细胞株构建。


其他服务项目:

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(三)东岭CRISPR/CAS9项目案例


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图2:T7E1检测基因组水平功能验证。将针对靶基因设计的5条sgRNA构建到sgRNA病毒载体,通过顺转导入CAS9稳转工具细胞株,可到>70%转染效率。转染3天后收集细胞基因组进行T7E1检测sgRNA切割效率,可见sgRNA 1/ 2/ 3/ 5均有较高切割效率。


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图3:成功构建基因敲除单克隆细胞株。将sgRNA1多克隆细胞进行单克隆铺板,扩增后的单克隆收集基因组通过PCR获得目的基因片段,进行测序发现克隆1/2分别有单个碱基和多个碱基的缺失突变,靶基因敲除单克隆细胞株构建成功。


(四)东岭CRISPR/CAS9相关载体、病毒和工具细胞


东岭团队经过长期积累,已改造获得多种CRISPR/CAS9及sgRNA相关载体用于敲除和敲入,以及spCAS9稳转工具细胞株供客户直接使用,具体信息如下表:


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